El Agua de los canales de Xochimilco , proviene de 3 plantas de tratamiento de la ciudad de México, así como de la lluvia. Pero la mala calidad del agua proviene de las aguas residuales desde los drenajes de las casas, la contaminación de los canales de Xochimilco proviene de agua jabonosa con la que se lava la ropa, así como de desechos de hoyos –no fosas sépticas- y desde donde se filtran aguas negras, así como drenajes, principalmente de los asentamientos irregulares, esto junto con las malas practicas del turismo de motor de gasolina hacen que el Ajolote este al borde de la extinción.